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根據志賀氏菌抗原構造的不同，可分為四群48個(gè)血清型（包括亞型）。
（1)A群:又稱(chēng)痢疾志賀氏菌(Sh.dysenteriae),通稱(chēng)志賀氏痢疾桿菌。不發(fā)酵甘露醇。有12個(gè)血清型，其中8型又分為三個(gè)亞型。
（2）B群：又稱(chēng)福氏志賀氏菌（Sh.flexneri），通稱(chēng)福氏痢疾桿菌。發(fā)酵甘露醇。有15個(gè)血清型（含亞型及變種），抗原構造復雜，有群抗原和型抗原。根據型抗原的不同，分為6型，又根據群抗原的不同將型分為亞型；X、Y變種沒(méi)有特異性抗原，僅有不同的群抗原。
（3）C群：又稱(chēng)鮑氏志賀氏菌（Sh.boydii），通稱(chēng)鮑氏痢疾桿菌。發(fā)酵甘露醇，有18個(gè)血清型，各型間無(wú)交叉反應。
（4）D群：又稱(chēng)宋內氏志賀氏菌（Sh.sonnei），通稱(chēng)宋內氏痢疾桿菌。發(fā)酵甘露醇，并遲緩發(fā)酵乳糖，一般需要3～4天。只有一個(gè)血清型。有兩個(gè)變異相，即Ⅰ相和Ⅱ相；Ⅰ相為S型，Ⅱ相為R型。
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